Kehidupan peribadi Lopez telah menarik perhatian media yang meluas.[21] Dari 22 Februari 1997, hingga Januari 1998, beliau telah berkahwin dengan pelayan Cuba Ojani Noa.[22] Sejak perkahwinan mereka yang singkat, Lopez telah mengalami banyak masalah undang-undang mengenai hubungannya dengan Noa. Pada April 2006, beliau menyaman untuk menghalangnya daripada menerbitkan buku tentang perkahwinan mereka, dengan menyatakan ia melanggar perjanjian kerahsiaan mereka.[23] Pada tahun berikutnya, penimbangtara yang dilantik oleh mahkamah mengeluarkan injunksi tetap yang melarang Noa daripada "mengkritik, menghina, menyerahkan cahaya negatif atau merendahkan" Lopez. Beliau dianugerahkan $ 545,000 ganti rugi pampasan dan Noa telah diarahkan untuk menyerahkan semua salinan bahan yang berkaitan dengan buku itu kepada Lopez atau peguamnya.[24] Satu tuntutan undang-undang mengenai video berbulan madu persendirian dalam penguasaan Noa kini sedang berjalan.[25]

Semasa menyiapkan album pertama, On the 6, Lopez mula berpacaran dengan penyanyi rap dan penerbit rakaman Sean Combs. Pada 27 Disember 1999, pasangan itu ditahan bersama dua orang lain berkaitan dengan penangkapan di luar Times Square Club di New York. Mereka didakwa memiliki jenayah senjata dan harta curi. Lopez tidak lama lagi dibebaskan, tanpa ada kaitan dengan jenayah itu.[26] Bagaimanapun, Combs didakwa dan didakwa oleh juri besar Manhattan.[27] Selepas meninggalkan Combs, Lopez menjalin hubungan dengan bekas penari Cris Judd, yang mana beliau telah berkahwin dari 29 September 2001 hingga Jun 2002.[28] Berikutan perceraiannya yang kedua akibat perbezaan yang tidak dapat dipertikaikan, Lopez memulakan hubungan berprofil tinggi dengan pelakon dan pengarah Ben Affleck, yang mana beliau bertunang pada November 2002.[29][30] Media mula merujuk kepada mereka sebagai "Bennifer", dan mereka menjadi "supercouple" terkemuka dalam media dan budaya popular. Bennifer menjadi istilah yang popular, yang akhirnya memasuki kamus bandar dan kamus neologisme sebagai ketara,[31] sebagai gabungan nama memulakan trend pasangan selebriti lain yang dirujuk oleh kombinasi nama pertama mereka.[32] Pasangan itu menangguhkan pertunangan mereka selama-lamanya sehari sebelum upacara yang dirancang pada bulan September 2003, dengan alasan gangguan media terhadap peristiwa itu sebagai alasannya.[33]

Berikutan pemisahannya dengan Affleck pada Januari 2004, Lopez mula berpacaran kawan lamanya, Marc Anthony (nama sebenarnya: Marco Antonio Muñiz). Pasangan itu berkahwin pada bulan Jun itu,[34][35] dan tinggal di Brookville, New York.[36] Dua lelaki cuba menebus video perkahwinan persendirian yang dicuri daripada pasangan itu untuk satu juta dolar; Walau bagaimanapun, mereka telah dituduh di Mahkamah Jenayah Manhattan atas tuduhan konspirasi, mencuba larseni besar dan memiliki harta curi.[37] Pada 7 November 2007, pada malam terakhir lawatan bersama mereka, Lopez dan Anthony secara rasminya mengesahkan bahawa mereka menjangkakan anak pertamanya.[38] Pengumuman itu menamatkan spekulasi selama kehamilan.[39] Bapanya mengesahkan bahawa pasangan itu mengharapkan kembar, mendedahkan bahawa ia berjalan di dalam keluarga: "Kakak saya juga mempunyai kembar, jadi itu adalah perkara keturunan."[40] Lopez, yang merupakan seorang penganut Roman Katolik, telah menyatakan bahawa kepercayaannya tidak menggalakkannya untuk menjalani rawatan persenyawaan in vitro semasa cuba hamil.[41]

Lopez melahirkan seorang anak lelaki, Maximilian David, dan seorang anak perempuan, Emme Maribel, di Long Island, New York, pada 22 Februari 2008.[42][43] Kembar ini diperkenalkan pada 11 Mac 2008, isu ''People'', yang mana majalah itu membayar $ 6 juta dilaporkan; gambar kembar tersebut menjadi gambar selebriti paling mahal yang pernah diambil pada masa itu.[44] Tiga tahun kemudian pada bulan Julai 2011, pasangan itu mengumumkan perpisahan mereka, dengan Anthony memfailkan perceraian pada April 2012.[45] Perceraian mereka telah dimuktamadkan pada 16 Jun 2014, dengan Lopez mengekalkan hak penjagaan fizikal utama kedua-dua anak.[46] Pada 31 Disember 2014, beliau secara sah mengubah namanya kembali ke Jennifer Lopez, menggugurkan nama terakhir Anthony (Muñiz).[47]

Lopez mempunyai hubungan langsung dengan bekas penari latarnya, Casper Smart dari Oktober 2011 hingga Ogos 2016.[48][49] Pada Februari 2017, beliau mula berpacaran dengan bekas pemain besbol New York Yankees Alex Rodriguez.[50][51]

Aktivisme

Lopez mengendors kempen presiden Presiden Barack Obama 2012, bercakap dalam iklan televisyen dan menghadiri acara pengumpulan dana untuk Obama di Paris.[52][53] Beliau mengendors calon presiden Demokrat Hillary Clinton pada 2016, yang menjalankan konsert percuma di Florida untuk menyokongnya pada Oktober.[53][54]